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全長鳥槍法測序技術服務|實驗技術服務
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全長鳥槍法測序技術服務|實驗技術服務——pCzn1質粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數據真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質粒,客戶可以依據我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產品品牌:全長鳥槍法測序技術服務|實驗技術服務 http://www.ybiotechmall.com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序實驗流程:
基因測序的方法 是在獲得一定的遺傳及物理圖譜信息的基礎上,繞過bac克隆逐個排序的過程,將基因組dna分解成2kb左右的小片段進行隨機測序,輔以一定數量的10kb的克隆和bac克隆的末端測序,利用超級計算機進行整合進行序列組裝。
系將大片段DNA(如噬菌體文庫中約40 kb長或**人工染色體所含350 kb長的DNA插入片段)隨機切成許多1~1.5 kb的小片段,分別對其測序,然后借助序列重疊區域拼接成全段序列。
優點是速度快,簡單易行,成本較低。但用它來測序,終排序結果的拼接組裝不太容易。
全基因組鳥槍法測序的主要步驟是:
**,建立高度隨機、插入片段大小為1.6kb到4kb左右的基因組文庫。克隆數要達到一定數量,即經過兩端測序的克隆片段的堿基總數應達到基因組大小的6到10倍。
**,高效、大規模的克隆雙向測序。
第三,序列組裝。借助Phred, Phrap, Consed 軟件進行序列組裝,產生一定數量的contig。
第四,填補缺口。有兩種待填補的缺口,一是沒有相應模板DNA的物理缺口,我們通過PCR的方法進行填補;二是有模板DNA但未測到的序列缺口,我們直接在模板DNA上設計引物測序。
鳥槍法測序適用范圍:BAC、Fosmid、cosmid、線粒體DNA、葉綠體DNA等。
大致步驟
1.使用限制性內切酶將帶有目的基因的DNA鏈切成若干小段。
2.再使用DNA連接酶將其整合到載體的基因中,并使其表達。
3.如果在某個細胞中得到了目的產物,就說明整合到該細胞中的DNA片段就是所需要的DNA片段。
鳥槍法測序的缺點
隨著所測基因組總量增大,所需測序的片段大量增加,各個片段重疊或一個連續體的概率是2n2-2n
高等真核生物(如人類)基因組中有大量重復序列,導致判斷失誤。
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